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《文献分享:Paired genetic analysis by next-generation sequencing of lung cancer and associated idiopathic pulmonary fibrosis》

发布时间:2021-08-31 本文来源:病理科

一、研究背景:

1. 特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis, IPF)是一种病因不明,慢性进行性纤维化间质性肺炎。

2. 肺癌是IPF患者最重要的合并症之一,在IPF患者人群中,肺癌的发病率在2.7%~48%之间,显著高于一般人群;特发性肺纤维化合并肺癌(IPF-associated lung cancer, IPF-LC发病机制很大程度上还不明确,研究认为IPF和肺癌疾病可能有共同的通路。目前认为IPFLC之间的关系有三种可能:IPF导致LC的发生;LC导致IPF的发生;LCIPF同时发生。目前更广泛的认为是IPF导致LC的发生。

3. IPF导致LC可能的机制:肺纤维化的瘢痕可引起淋巴管阻塞,致使局部潜在致癌物质增加;肺组织的炎症改变以及继之上皮不典型纤维化可能使其易于发生肺癌;基因改变可能促使肺癌的发生。

二、研究方法与思路:


  1. 研究思路1:目前尚不清楚IPF-LC患者肺肿瘤和纤维化肺组织是否有相同的基因改变;研究思路2:目前尚不清楚IPF-LC是否通过纤维化肺组织基因改变的逐步积累发展而来。

  2. 研究方法:使用NGS(二代基因测序)检测IPF-LC患者的肺肿瘤和邻近纤维化肺组织的基因组谱。

三、研究结果

1. 17例非小细胞肺癌患者肿瘤组织体系突变,有97个基因发生改变,且发现RAS-RAF通路在IPF-LC患者的肿瘤发生中起重要作用

2. 15例患者纤维化肺组织体系突变,发现有69个基因改变。

3. 配对肿瘤组织和纤维化肺组织的重叠体系突变仅有6个。

四、讨论

1. 研究第一次利用靶向NGS研究成对的肿瘤和肿瘤邻近纤维化肺组织标本的基因改变

2. 在肿瘤和IPF样本中发现的大多数基因,不是相同的基因突变类型:在LC肿瘤和IPF样本中检测到多种基因突变频率较高,如TP53突变,虽然所有TP53突变都位于编码蛋白的DNA结合域(识别与DNA修复和凋亡相关基因启动子),但它们突变类型不同;

3. 对配对肿瘤和IPF样本进行更全面的NGS分析有助于进一步了解IPF相关肺癌的病因,并为此类肿瘤和IPF靶向药物的开发提供基础



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