HPV感染可以引起宫颈癌、宫颈上皮内瘤、尖锐湿疣等多种生殖系统疾病。根据HPV的致癌危险性，可将HPV分为低危型和高危型两大类，低危型HPV感染多引起生殖道上皮细胞良性病变，如尖锐湿疣、宫颈上皮内瘤Ⅰ；而高危型HPV感染则可引起宫颈癌、宫颈上皮内瘤Ⅱ、宫颈上皮内瘤Ⅲ等子宫颈恶性病变。应用流式荧光杂交技术可一次同时检测26种亚型的HPV-DNA（包括7种低危型和19种高危型）。便于早期发现和筛查宫颈癌前病变、宫颈癌、尖锐湿疣、宫颈上皮内瘤等多种女性生殖系统疾病。
| 检测项目 | HPV亚型 |
| HPV低危亚型（7种） | HPV 6、11、40、42、44、53、54型。 |
| HPV高危亚型（19种） | HPV 16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、55、58、56、59、61、66、68、73、83型。 |
HPV亚型与常见生殖道疾病的关系
| 病变类型 | 检测的HPV亚型 |
| 尖锐湿疣 | HPV6、11、16、18、31、33、35、39、40、42、44、45、51、52、53型等 |
| 宫颈上皮内瘤 | HPV16、18、31、33、35、39、40、44、45、51、52、53、58、61、68型等 |
| 鲍温样丘疹病 | HPV16、18、39型等 |
| 浸润性宫颈癌 | HPV16、18、31、33、35、39、45、52、58、61、66、68型等 |
| 阴茎癌 | HPV16、18型等 |
| 女阴癌 | HPV16、18型等 |
| 肛管癌 | HPV16、18型等 |
| 咽喉癌 | HPV16、18型等 |
